Jeg vil foreslå at du bruger din installations CD med Ubuntu og booter op fra den, åbner "System > Administration > Partition Editor" , sørger for at de partitioner du har brugt til Ubuntu er unmounted og så slet dem. Derefter, hvis de skal bruges til windows, formaterer dem til ntfs med samme program. Derefter er det bare at lukke live-sessionen ned og Ubuntu er væk.
Har du kørt med dual-boot med fx win-xp vil du nu have et problem med din mbr (master boot record) men det er der et fix for her:
http://ubuntudanmark.dk/forum/viewtopic.php?f=2&t=7850&sid=50c138574875bd493d4aed2599b17827&p=48519